分析国外针灸研究的文献不难发现，其研究目的、病种选择、研究方法、看问题的角度以及研究结论等，与国内针灸研究不尽相同。
发表在高水平期刊上的国外针灸研究显示，真针刺和假针刺、穴位和非穴位刺激均可产生相似的、没有统计学差异的疗效；针刺与安慰对照的效果相似；经皮电神经刺激疗法和扳机点刺激疗法等照样可以产生不错的疗效，显示不用传统针灸理论指导照样可以产生治疗效果。这些对传统针灸腧穴功能的特异性以及不同针灸手法等不同的针刺方法的疗效特异性提出了质疑。
然而值得注意的是，现代的西方针灸研究界完全是从实用主义出发，在目前尚缺乏科学证据证明传统针灸理论的科学性和临床指导价值的现实情况下，逐步在形成他们自己一套简单的、但确实在一定程度上能够有效指导临床的“西方针灸”理论体系，不得不引起国内针灸研究者的深思。
国内对针灸理论的研究开展了几十年，严格来讲，迄今仍难拿出令科学界信服的科学证据来证明其科学性和临床实用性或指导价值。到目前为止，国内积累的科学证据也描述不了古代文献和现代教科书所记载的经络系统的完整面貌，也证明不了某经或某经上的腧穴只能单单特异性地治疗其所络属的内脏的疾病。对于腧穴特异性的研究也没有积累系统的科学证据来证明穴位和非穴位可以产生不同疗效的科学机制；也没有严谨的实验和临床证据证明不同针刺手法可以产生不同疗效的科学基础。
今后我们的研究、尤其是基础研究，再也不能局限于从理论到理论的研究模式，必须改变那种文献理论研究、动物实验研究及临床应用研究之间相互脱节的现状，今后的针灸研究过程中，应将三者有机地结合起来。从重新梳理不同发展阶段的针灸传统理论体系的角度出发，力求找到其科学合理的内核，再加以科学研究和临床验证，在此基础上重构一个既根于针灸传统理论内核、又立于科学证据基础上并能有效指导临床治疗的新的针灸理论体系。
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