抗酸药是冶疗胃及十二指肠溃疡的常用药。临床治疗溃疡病的药物有两大类：即抗酸药和抑制胃酸分泌的药物；其中碱性抗酸药能中和胃酸，发挥明显的止痛作用，如碳酸镁、氢氧化铝等。此类抗酸药抗酸效果强、作用快、止痛效果好，但对溃疡愈合不如抑制胃酸分泌药物好。故临床上常将两药配合使用，既能缓解疼痛，又可达到治溃疡的目的。
选准时间，事半功倍影响抗酸药使用效果的有3个因素：抗酸药的中和能力；胃酸分泌的速率；胃排空的速率。其中以第3个因素最重要。因此抗酸药的用药时间便成为合理治疗的最重要一环。
尤其是碱性抗酸药，如果饭前空腹服药，药物很快在体内排出，起不到中和胃酸的作用。但是餐后马上服药也不行，因食物可以中和胃酸，使胃内酸碱度在短时间内上升，因此餐后服药意义也不大。
最佳的服药时间，是在餐后1小时。因为进食后食物会刺激胃酸分泌，一般在餐后1小时胃酸分泌明显增多，此时胃排空最慢，胃酸含量最高。如此时服用抗酸药，可发挥药物最大的中和胃酸能力。
用药不可半途而废抗酸治疗的目的在于使溃疡完全愈合，而在溃疡完全愈合之前，症状往往早已消失。因此，绝对不应以症状消失作为停止抗酸治疗的标准。否则，症状会迅速重现，这实际上是原有溃疡的恶化而不是疾病的复发。因此，抗酸治疗的时间不应少于3个月。
但是值得注意的是，近年来国外有研究称，服用抗酸药易导致骨质疏松、髋关节骨折。芝加哥消化疾病周的会议中提出，患者连续服用抗酸药，2年后出现髋关节骨折的风险增加。因此，对于一般性的上消化道溃疡、胃食道反流病的患者，尤其是老年患者，服用抗酸药疗程不应过长，而且应加强对骨质疏松的检查和预防。若患者病情需要持续服用抗酸药，应该选用最小有效剂量治疗，并且每服用2年到医院检查骨密度，这样可以降低骨质疏松、骨折的危险。同时最好预防性口服钙剂及维生素D3，适当进行户外活动及晒太阳。已有骨质疏松的，应避免长期使用抗酸药。
注意剂型，科学搭配除了用药时间以外，剂型的选择同样重要。一般来说，液态或粉剂抗酸药较片剂更有效，这可能是前者分散更快的结果。试管内的实验表明，同一抗酸药的片剂较液态制剂的中和效能低。若应用片剂，应该在咽下前嚼碎。
此外，抗酸药不能与抑制胃酸分泌药(如雷尼替丁、奥美拉唑)同服，否则会影响治疗效果。抑制胃酸分泌药宜在早起和睡前空腹服用。患者如果同时服用胃黏膜保护剂(如丽珠得乐)，则须与抗酸药、抑酸药错开1小时左右，因为胃黏膜保护剂类药物需要在酸性环境下才能形成保护膜。
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